Villagrán llegó a Lanús en 1984, proveniente del Plaza Colonia de su país natal. Rápidamente demostró su talento, destacándose por su habilidad como media punta o delantero y, sobre todo, por su excepcional pegada en los tiros libres, que se convirtieron en su marca registrada. ​ Durante su paso por el club, que se extendió hasta 1992, Villagrán disputó 315 partidos y convirtió 113 goles, consolidándose como el máximo goleador extranjero en la historia de Lanús. Uno de los momentos más memorables de su carrera fue el ascenso a Primera División en 1990, tras 13 años del club en categorías inferiores. En la final contra Quilmes, Villagrán convirtió el penal decisivo que le dio el ascenso a Lanús. Este gol, además, fue el número 100 de su cuenta personal con la camiseta granate. Tras su retiro, Villagrán continuó ligado al fútbol y a Lanús, trabajando en las divisiones inferiores del club y como coordinador en Victoriano Arenas, institución con la que Lanús tiene un convenio. Su legado como ídolo de Lanús y su contribución a la historia del club permanecen intactos en la memoria de los hinchas.